2001年中国加入WTO和2002年中国东盟自贸区建设正式启动，中国东盟农产品贸易快速增长。由于中国对东盟农产品的进口增速大于出口增速，2001─2011年，中国对东盟的农产品贸易一直处于逆差地位，而且贸易逆差呈现不断扩大的趋势。采用显示性比较优势指数和贸易补偿指数分析发现：中国东盟农产品贸易朝着体现双边比较优势的方向发展，但中国农产品的比较优势不断下降，东盟农产品的比较优势在波动中缓慢上升；同时，中国出口和东盟进口的农产品贸易互补性指数较低且不断下降，东盟出口和中国进口的农产品贸易互补性指数缓慢上升。这将严重影响未来中国对东盟农产品出口的增长潜力。